Introduction
1.
Bioinformatics
❱
1.1.
Semester-one
❱
1.1.1.
CMB
❱
1.1.1.1.
Linux
1.1.1.2.
Python
❱
1.1.1.2.1.
Python Basics
1.1.1.2.2.
Functions
1.1.1.2.3.
Higher-Order Functions
1.1.1.2.4.
Tuples and Sets
1.1.1.2.5.
Useful modules
1.1.1.2.6.
Files and Sys
1.1.1.2.7.
Recursive Functions
1.1.1.2.8.
Exceptions
1.1.1.2.9.
Debugging
1.1.1.2.10.
Dictionaries
1.1.1.2.11.
Regular Expressions
1.1.1.2.12.
Object-Oriented Programming V2
1.1.1.2.13.
OOP: Extra Practice
1.1.1.2.14.
Object-Oriented Programming V1
1.1.1.2.15.
Inheritance
1.1.1.2.16.
Dynamic Programming
1.1.1.3.
Problem Solving
❱
1.1.1.3.1.
List & Matrix
❱
1.1.1.3.1.1.
Tic-Tac-Toe
1.1.1.3.1.2.
Multiplication Table
1.1.1.3.1.3.
Sieve of Eratosthenes
1.1.1.3.1.4.
Spiral Matrix
1.1.1.3.1.5.
Rotate Image
1.1.1.3.1.6.
Set Matrix Zeroes
1.1.1.3.2.
Two Pointers
❱
1.1.1.3.2.1.
Two Pointers Intro
1.1.1.3.2.2.
Reverse String
1.1.1.3.2.3.
Two Sum II - Input Array Is Sorted
1.1.1.3.2.4.
3sum
1.1.1.3.2.5.
Container With Most Water
1.1.1.3.2.6.
Remove Duplicates from Sorted Array
1.1.1.3.2.7.
Move Zeroes
1.1.1.3.2.8.
Valid Palindrome
1.1.1.3.3.
Sliding windows
❱
1.1.1.3.3.1.
Sliding Window Intro
1.1.1.3.3.2.
Longest Substring Without Repeating Characters
1.1.1.3.3.3.
Maximum Number of Vowels in a Substring of Given Length
1.1.1.3.4.
Dynamic Programming
❱
1.1.1.3.4.1.
Climbing Stairs
1.1.1.3.4.2.
Counting Bits
1.1.1.3.4.3.
Decode Ways
1.1.1.3.4.4.
Maximal Square
1.1.1.3.4.5.
Word Break
1.1.1.3.4.6.
Longest Increasing Subsequence
1.1.1.3.5.
Prefix Sum
❱
1.1.1.3.5.1.
Subarray Sum Equals K
1.1.1.3.5.2.
Count Vowel Substrings
1.1.1.3.6.
Dictionary
❱
1.1.1.3.6.1.
Roman to Integer
1.1.1.3.7.
Regular Expression
❱
1.1.1.3.7.1.
Basic Calculator
1.1.1.4.
Biological Algorithms
❱
1.1.1.4.1.
String Metrics and Alignments
1.1.1.5.
Resources
1.1.2.
Lab of BIOINFO
1.1.3.
Bio-Databases
❱
1.1.3.1.
Intro
1.1.3.2.
Everything
1.1.3.3.
Biological Databases
❱
1.1.3.3.1.
Boolean Algebra in Nutshell
1.1.3.3.2.
PubMed/MeSH
1.1.3.3.3.
Protein Databases
1.1.3.3.4.
UCSF-Chimera
1.1.3.3.5.
UniProt
1.1.3.3.6.
NCBI
1.1.3.3.7.
ENSEMBL
1.1.3.4.
Tools
❱
1.1.3.4.1.
This Container Has a Snake
1.1.3.5.
Pandas
1.1.3.6.
Database Systems & Theory
❱
1.1.3.6.1.
Introduction to Databases
1.1.3.6.2.
CAP Theorem
1.1.3.6.3.
SQLite
1.1.3.6.4.
NOT FOR EXAM
❱
1.1.3.6.4.1.
ACID -not for exam
1.1.3.6.4.2.
DBMS Architecture -not for exam
1.1.3.6.4.3.
Concurrency Control Theory -not for exam
1.1.3.6.4.4.
How Databases Actually Store Your Data
1.1.3.6.4.5.
Modern SQL
1.1.3.7.
Programmatic Interaction with Bio-DB
1.1.3.8.
Create Your Own Database
1.1.3.9.
CHEAT SHEETs
1.1.4.
Bioanalytical Proteomics
❱
1.1.4.1.
V2 Notes
❱
1.1.4.1.1.
Lec1 Notes V2
1.1.4.1.2.
Lec2 Notes V2
1.1.4.1.3.
Lec3 Notes V2
1.1.4.1.4.
Lec4 Notes V2
1.1.4.1.5.
Lec5 Notes V2
1.1.4.1.6.
Lec6 Notes V2
1.1.4.2.
Oral Questions
❱
1.1.4.2.1.
Oral Questions (Part one)
1.1.4.2.2.
Quantitative Proteomics Oral Questions
1.1.4.2.3.
Interactomis
1.1.4.2.4.
Important Oral Questions (Core Exam Questions)
1.1.5.
Genomics
❱
1.1.5.1.
PLINK Genotype File Formats
1.1.5.2.
Sanger Sequencing
1.1.5.3.
Lec2
1.1.5.4.
Ion Torrent
1.1.5.5.
Lec3
1.1.5.6.
ABI SOLiD
1.1.5.7.
Illumina
1.1.5.8.
Nanopore sequencing
1.1.5.9.
PacBIO
1.2.
Semester-two
❱
1.2.1.
Algorithms and Data Structures
1.2.2.
DNA/RNA Dynamics
1.2.3.
Big Data Processing & Infrastructures
1.2.4.
Molecular Phylogenetics
1.2.5.
Applied Machine Learning - Advanced
1.2.6.
Applied Machine Learning - Basic
License
Contributors
Light
Rust
Coal
Navy
Ayu
Bioinformatics Forever
Introduction to Big Data Processing Infrastructures