1. Introduction
  2. 1. Bioinformatics
    ❱
    1. 1.1. Semester-one
      ❱
      1. 1.1.1. CMB
        ❱
        1. 1.1.1.1. Linux
        2. 1.1.1.2. Python
          ❱
          1. 1.1.1.2.1. Python Basics
          2. 1.1.1.2.2. Functions
          3. 1.1.1.2.3. Higher-Order Functions
          4. 1.1.1.2.4. Tuples and Sets
          5. 1.1.1.2.5. Useful modules
          6. 1.1.1.2.6. Files and Sys
          7. 1.1.1.2.7. Recursive Functions
          8. 1.1.1.2.8. Exceptions
          9. 1.1.1.2.9. Debugging
          10. 1.1.1.2.10. Dictionaries
          11. 1.1.1.2.11. Regular Expressions
          12. 1.1.1.2.12. Object-Oriented Programming V2
          13. 1.1.1.2.13. OOP: Extra Practice
          14. 1.1.1.2.14. Object-Oriented Programming V1
          15. 1.1.1.2.15. Inheritance
          16. 1.1.1.2.16. Dynamic Programming
        3. 1.1.1.3. Problem Solving
          ❱
          1. 1.1.1.3.1. List & Matrix
            ❱
            1. 1.1.1.3.1.1. Tic-Tac-Toe
            2. 1.1.1.3.1.2. Multiplication Table
            3. 1.1.1.3.1.3. Sieve of Eratosthenes
            4. 1.1.1.3.1.4. Spiral Matrix
            5. 1.1.1.3.1.5. Rotate Image
            6. 1.1.1.3.1.6. Set Matrix Zeroes
          2. 1.1.1.3.2. Two Pointers
            ❱
            1. 1.1.1.3.2.1. Two Pointers Intro
            2. 1.1.1.3.2.2. Reverse String
            3. 1.1.1.3.2.3. Two Sum II - Input Array Is Sorted
            4. 1.1.1.3.2.4. 3sum
            5. 1.1.1.3.2.5. Container With Most Water
            6. 1.1.1.3.2.6. Remove Duplicates from Sorted Array
            7. 1.1.1.3.2.7. Move Zeroes
            8. 1.1.1.3.2.8. Valid Palindrome
          3. 1.1.1.3.3. Sliding windows
            ❱
            1. 1.1.1.3.3.1. Sliding Window Intro
            2. 1.1.1.3.3.2. Longest Substring Without Repeating Characters
            3. 1.1.1.3.3.3. Maximum Number of Vowels in a Substring of Given Length
          4. 1.1.1.3.4. Dynamic Programming
            ❱
            1. 1.1.1.3.4.1. Climbing Stairs
            2. 1.1.1.3.4.2. Counting Bits
            3. 1.1.1.3.4.3. Decode Ways
            4. 1.1.1.3.4.4. Maximal Square
            5. 1.1.1.3.4.5. Word Break
            6. 1.1.1.3.4.6. Longest Increasing Subsequence
          5. 1.1.1.3.5. Prefix Sum
            ❱
            1. 1.1.1.3.5.1. Subarray Sum Equals K
            2. 1.1.1.3.5.2. Count Vowel Substrings
          6. 1.1.1.3.6. Dictionary
            ❱
            1. 1.1.1.3.6.1. Roman to Integer
          7. 1.1.1.3.7. Regular Expression
            ❱
            1. 1.1.1.3.7.1. Basic Calculator
        4. 1.1.1.4. Biological Algorithms
          ❱
          1. 1.1.1.4.1. String Metrics and Alignments
        5. 1.1.1.5. Resources
      2. 1.1.2. Lab of BIOINFO
      3. 1.1.3. Bio-Databases
        ❱
        1. 1.1.3.1. Intro
        2. 1.1.3.2. Everything
        3. 1.1.3.3. Biological Databases
          ❱
          1. 1.1.3.3.1. Boolean Algebra in Nutshell
          2. 1.1.3.3.2. PubMed/MeSH
          3. 1.1.3.3.3. Protein Databases
          4. 1.1.3.3.4. UCSF-Chimera
          5. 1.1.3.3.5. UniProt
          6. 1.1.3.3.6. NCBI
          7. 1.1.3.3.7. ENSEMBL
        4. 1.1.3.4. Tools
          ❱
          1. 1.1.3.4.1. This Container Has a Snake
        5. 1.1.3.5. Pandas
        6. 1.1.3.6. Database Systems & Theory
          ❱
          1. 1.1.3.6.1. Introduction to Databases
          2. 1.1.3.6.2. CAP Theorem
          3. 1.1.3.6.3. SQLite
          4. 1.1.3.6.4. NOT FOR EXAM
            ❱
            1. 1.1.3.6.4.1. ACID -not for exam
            2. 1.1.3.6.4.2. DBMS Architecture -not for exam
            3. 1.1.3.6.4.3. Concurrency Control Theory -not for exam
            4. 1.1.3.6.4.4. How Databases Actually Store Your Data
            5. 1.1.3.6.4.5. Modern SQL
        7. 1.1.3.7. Programmatic Interaction with Bio-DB
        8. 1.1.3.8. Create Your Own Database
        9. 1.1.3.9. CHEAT SHEETs
      4. 1.1.4. Bioanalytical Proteomics
        ❱
        1. 1.1.4.1. V2 Notes
          ❱
          1. 1.1.4.1.1. Lec1 Notes V2
          2. 1.1.4.1.2. Lec2 Notes V2
          3. 1.1.4.1.3. Lec3 Notes V2
          4. 1.1.4.1.4. Lec4 Notes V2
          5. 1.1.4.1.5. Lec5 Notes V2
          6. 1.1.4.1.6. Lec6 Notes V2
        2. 1.1.4.2. Oral Questions
          ❱
          1. 1.1.4.2.1. Oral Questions (Part one)
          2. 1.1.4.2.2. Quantitative Proteomics Oral Questions
          3. 1.1.4.2.3. Interactomis
          4. 1.1.4.2.4. Important Oral Questions (Core Exam Questions)
      5. 1.1.5. Genomics
        ❱
        1. 1.1.5.1. PLINK Genotype File Formats
        2. 1.1.5.2. Sanger Sequencing
        3. 1.1.5.3. Lec2
        4. 1.1.5.4. Ion Torrent
        5. 1.1.5.5. Lec3
        6. 1.1.5.6. ABI SOLiD
        7. 1.1.5.7. Illumina
        8. 1.1.5.8. Nanopore sequencing
        9. 1.1.5.9. PacBIO
    2. 1.2. Semester-two
      ❱
      1. 1.2.1. Algorithms and Data Structures
      2. 1.2.2. DNA/RNA Dynamics
      3. 1.2.3. Big Data Processing & Infrastructures
      4. 1.2.4. Molecular Phylogenetics
      5. 1.2.5. Applied Machine Learning - Advanced
      6. 1.2.6. Applied Machine Learning - Basic
  3. License
  4. Contributors

Bioinformatics Forever

DNA/RNA Dynamics